消毒室药物制剂和医疗器械生产实践中的强制步骤。消毒的目的就是保持工作席、房间、设备和家具的微生物洁净度，还要保持防护工作服和接触灭菌对象的人手皮肤表层的微生物的洁净度。
工业生产的消毒器材的数量非常繁多，但是其中没有一种是万能的，从对不同的微生物的消毒效果，还是在使腐蚀性最低和对人员无害方面都是如此，但是不管消毒器材有何种化学特性，其最终的目的就是破坏活性细胞赖以生存的微生物蛋白质。虽然所有消毒器材都作用于细胞蛋白质，但是其作用机理却是各不相同的。
在实际中最广泛地采用着下列各种消毒器材：
·酚（甲酚、奈、杂甲酚）；
·含卤物质（氯胺、次氯酸铵、气态氯、碘）；
·碱（氢氧化钾和氢氧化钠）；
·双氧水；
·福尔马林；
·乙醇和异丙基醇，70%的水溶液；
对不同的微生物而言，杀灭微生物器材的作用效果也是各不相同的；
具有杀灭孢子的灭菌物质，为数不是太多，这类物质有：杂醛，甲酸，卤素，乙烯氧化物，双氧水。
某些灭菌物质具有灭菌杀毒的能力，但是灭菌活性并不是杀灭病毒的活性。
